В 1993 году появились первые дети-сироты и почти одновременно с ними первые старички богадельни. До 1995 года дети Пустыни посещали школу села Новое. Желая воспитывать и образовывать детей непосредственно в непротиворечивом христианском мировоззрении, родилась идея создания Православной классической Гимназии.
Созданная в 1995 году Православная классическая Гимназия развивает и активно использует бесценные наработки русской педагогической мысли, науки и практики дореволюционного и советского периодов нашей школы. Истинным сокровищем школы являются творения великих педагогов прошлого К.Д. Ушинского, С.А. Рачинского, А.П. Киселева, методологов 40-х – 50-х годов 20-го века. У школы хорошая учебная база, великолепно оборудованные кабинеты, лаборатории, компьютерные классы, спортивный зал, универсальная спортивная площадка.